More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1558 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  57.59 
 
 
209 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.89 
 
 
214 aa  165  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.77 
 
 
199 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.6 
 
 
212 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.5 
 
 
216 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  42.86 
 
 
211 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  42.86 
 
 
211 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  42.86 
 
 
211 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  42.86 
 
 
211 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  42.86 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  42.86 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  41.26 
 
 
206 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.35 
 
 
218 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.45 
 
 
216 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2105  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.63 
 
 
211 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  42.36 
 
 
211 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.35 
 
 
218 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  44 
 
 
204 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  43.28 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  42.29 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  40.09 
 
 
208 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  43.56 
 
 
206 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  42.29 
 
 
204 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  42.29 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  42.29 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  41.46 
 
 
215 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  41.29 
 
 
204 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  42.29 
 
 
204 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  42.29 
 
 
204 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  40.98 
 
 
227 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 
208 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.81 
 
 
208 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 
208 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  41.29 
 
 
204 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 
210 aa  141  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.93 
 
 
208 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  39.71 
 
 
207 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 
208 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.04 
 
 
211 aa  140  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  41.23 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  39.23 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  42.42 
 
 
194 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  42.42 
 
 
194 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  42.42 
 
 
194 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  42.42 
 
 
194 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  40.57 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  41.38 
 
 
211 aa  138  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.29 
 
 
206 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  38.14 
 
 
209 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  47.12 
 
 
215 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.59 
 
 
208 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
208 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  40.09 
 
 
210 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.4 
 
 
225 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  38.76 
 
 
207 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 
203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  40.28 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  40.28 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  38.83 
 
 
208 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.54 
 
 
208 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  40.57 
 
 
210 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  38.46 
 
 
208 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.9 
 
 
210 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.5 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  41.21 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  38.24 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4170  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.46 
 
 
206 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319888  normal  0.802735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 
213 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  39.72 
 
 
214 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 
213 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  41.29 
 
 
217 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  39.15 
 
 
210 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  36.92 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.08 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  36.19 
 
 
217 aa  129  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
242 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3172  lysine exporter protein LysE/YggA  43.93 
 
 
211 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 
211 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  38.82 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  39.61 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.97 
 
 
213 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.79 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 
207 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.5 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  39.23 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.16 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.44 
 
 
218 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.28 
 
 
207 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.88 
 
 
209 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  41.98 
 
 
212 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 
209 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 
209 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>