More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1541 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1541  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  874    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907452  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
460 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  37.96 
 
 
525 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.2 
 
 
521 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  38.72 
 
 
632 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
776 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 
528 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  36.53 
 
 
468 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
470 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 
422 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
507 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  37.04 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.08 
 
 
678 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  35.13 
 
 
675 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  35.52 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 
659 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
562 aa  118  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 
418 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  36.86 
 
 
703 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.1 
 
 
532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
766 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  35.02 
 
 
534 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  35.45 
 
 
621 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 
638 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  35.57 
 
 
481 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.77 
 
 
659 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.59 
 
 
446 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 
264 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
695 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
487 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  37.67 
 
 
493 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  31.27 
 
 
501 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
595 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.6 
 
 
596 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.77 
 
 
668 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
468 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 
674 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
563 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  32.96 
 
 
705 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 
503 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
673 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
631 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
575 aa  96.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
345 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  42 
 
 
531 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
605 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  32.96 
 
 
564 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
525 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 
554 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
296 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  29.83 
 
 
571 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 
583 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 
855 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 
501 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
493 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  34.46 
 
 
621 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 
1029 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
612 aa  83.2  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
535 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  31.22 
 
 
650 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
674 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.99 
 
 
579 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.19 
 
 
632 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
556 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.67 
 
 
512 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
617 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  37.71 
 
 
497 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
556 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  37.58 
 
 
581 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 
646 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
557 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  28.02 
 
 
638 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  32.16 
 
 
625 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.07 
 
 
662 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  28.73 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 
543 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 
651 aa  73.6  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  31.07 
 
 
593 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.65 
 
 
627 aa  73.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.88 
 
 
863 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  32.08 
 
 
623 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
567 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.26 
 
 
551 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 
535 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 
660 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.2 
 
 
598 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  36.6 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.27 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  28.1 
 
 
575 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
646 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1543  hypothetical protein  34.64 
 
 
572 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
721 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>