More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1494 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 438 aa  897    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  53.4 
 
 		 425 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  51.67 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  28.82 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 419 aa  137  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.02 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 419 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.71 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 432 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 433 aa  100  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 435 aa  96.3  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.07 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.98 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.98 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  25.98 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.26 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.7 
 
 		 430 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.19 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.86 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.81 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 411 aa  87.4  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.72 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.36 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.87 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.2 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.33 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5097  extracellular solute-binding protein family 1  28.51 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.68 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  30.49 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  30.49 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.93 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.93 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  26.01 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.44 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.53 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>