33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1411 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  826    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  36.9 
 
 		 514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  36.36 
 
 		 439 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  41.14 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  37.18 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  37.8 
 
 		 398 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  37.8 
 
 		 398 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  37.8 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  38.25 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  39.74 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  33.43 
 
 		 422 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  31.59 
 
 		 479 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  31.27 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  33.59 
 
 		 470 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  37.06 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  34.08 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  29.63 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  31.15 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  34.62 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  31.93 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  30.48 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  32.62 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  29.97 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  29.41 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  29.17 
 
 		 348 aa  90.5  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  29.47 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  30.05 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  32.39 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3671  hypothetical protein  27.81 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  34.18 
 
 		 2179 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  29.93 
 
 		 284 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  32.1 
 
 		 2272 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>