24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1410 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  decreased coverage  0.00637292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13721  hypothetical protein  45.92 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.335566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5453  hypothetical protein  45.92 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792473  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1339  hypothetical protein  44.12 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4858  hypothetical protein  42.33 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4947  hypothetical protein  42.33 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5226  hypothetical protein  42.33 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3747  putative integral membrane protein  39.23 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2498  putative integral membrane protein  36.71 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.507702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4046  hypothetical protein  45.05 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2714  integral membrane protein  32.66 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0139208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7596  putative integral membrane protein  42.41 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  0.0253276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2516  hypothetical protein  42.29 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5844  putative integral membrane protein  44.95 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1847  hypothetical protein  44.71 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2334  hypothetical protein  38.24 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0355471  decreased coverage  0.000000483756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0761  putative integral membrane protein  32.44 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1830  hypothetical protein  29.35 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.884278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3817  integral membrane protein  35.82 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417519  normal  0.0124075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2445  integral membrane protein  35.29 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4819  hypothetical protein  26.67 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09320  hypothetical protein  33.82 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.54682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20670  hypothetical protein  29.68 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0562774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3908  integral membrane protein  28.77 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>