24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1409 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1409  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  737    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  decreased coverage  0.00798982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4859  hypothetical protein  49.33 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4948  hypothetical protein  49.33 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5227  hypothetical protein  49.33 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5454  hypothetical protein  45.69 
 
 		 379 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1338  hypothetical protein  46.74 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4047  hypothetical protein  45.04 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.403279  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13722  hypothetical protein  46.43 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.471564 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2499  hypothetical protein  44.73 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0272101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7597  secreted protein  44.67 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  hitchhiker  0.00981845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2517  hypothetical protein  40.93 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09310  hypothetical protein  39.27 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1831  hypothetical protein  34.51 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2335  hypothetical protein  38.57 
 
 		 396 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0462742  decreased coverage  0.000000721726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3748  hypothetical protein  43.14 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1846  hypothetical protein  32.98 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3909  secreted protein  34.18 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3818  hypothetical protein  36.98 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0637616  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2446  hypothetical protein  35.81 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0760  hypothetical protein  34.79 
 
 		 489 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2715  hypothetical protein  41.35 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5845  hypothetical protein  34.64 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142107  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4820  hypothetical protein  30.37 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20680  hypothetical protein  32.35 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>