More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1387 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  77.29 
 
 
456 aa  640    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  100 
 
 
450 aa  899    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  84.04 
 
 
451 aa  733    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  71.3 
 
 
453 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  71.43 
 
 
454 aa  631  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  72.44 
 
 
449 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  69.28 
 
 
455 aa  617  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  67.63 
 
 
450 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  69.91 
 
 
451 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  69.54 
 
 
452 aa  597  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  71.24 
 
 
453 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  66.08 
 
 
454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  65.23 
 
 
461 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  65.27 
 
 
471 aa  549  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  65.23 
 
 
461 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  61.17 
 
 
497 aa  551  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  64.68 
 
 
454 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  62.75 
 
 
456 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  62.91 
 
 
469 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  61.01 
 
 
488 aa  530  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  60.17 
 
 
491 aa  530  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  60.82 
 
 
475 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  59.96 
 
 
529 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  59.34 
 
 
502 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  59.27 
 
 
472 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  62.14 
 
 
464 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4726  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  61.64 
 
 
465 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267989  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  61.15 
 
 
465 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  61.15 
 
 
465 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  60.93 
 
 
465 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  62.73 
 
 
465 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  57.66 
 
 
479 aa  492  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  58.49 
 
 
487 aa  481  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1952  phosphomannomutase  62.98 
 
 
414 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322718  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  55.73 
 
 
451 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  50.56 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20740  phosphomannomutase  54.33 
 
 
592 aa  415  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00626227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  45.96 
 
 
447 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  44.17 
 
 
446 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  44.77 
 
 
813 aa  349  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  44.99 
 
 
444 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  43.05 
 
 
456 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  43.9 
 
 
448 aa  338  9e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  41.61 
 
 
450 aa  336  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  43.64 
 
 
456 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  43.68 
 
 
448 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  42.25 
 
 
450 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  39.02 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  41.59 
 
 
453 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  40.81 
 
 
447 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  39.38 
 
 
456 aa  319  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  39.25 
 
 
457 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  39.25 
 
 
457 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  39.25 
 
 
457 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  38.8 
 
 
457 aa  316  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  40.51 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  39.1 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  41.12 
 
 
450 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  38.46 
 
 
457 aa  313  5.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  38.79 
 
 
456 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  41.04 
 
 
448 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  40.67 
 
 
450 aa  312  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  42.03 
 
 
454 aa  312  9e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  38.88 
 
 
456 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  38.88 
 
 
456 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  42.35 
 
 
453 aa  311  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  39.1 
 
 
456 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  38.88 
 
 
456 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  40.62 
 
 
456 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  40.4 
 
 
456 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  38.98 
 
 
455 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  38.88 
 
 
456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  42.89 
 
 
448 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  39.04 
 
 
456 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  38.08 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  38.57 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  40.62 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  41.28 
 
 
448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  40.04 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  39.69 
 
 
456 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  41.16 
 
 
453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  38.36 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  39.46 
 
 
456 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  39.42 
 
 
449 aa  305  9.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  39.42 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  36.69 
 
 
481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  39.01 
 
 
450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  38.85 
 
 
470 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  40.93 
 
 
453 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  39.86 
 
 
460 aa  301  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  41.93 
 
 
473 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  38.3 
 
 
493 aa  300  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  37 
 
 
486 aa  299  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  40.22 
 
 
467 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  41.15 
 
 
450 aa  296  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  36.21 
 
 
486 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.36 
 
 
458 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  40.36 
 
 
458 aa  293  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  38 
 
 
463 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  37.53 
 
 
487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>