31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1372 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  591  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  62.33 
 
 
325 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  38.01 
 
 
314 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  42.07 
 
 
327 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  42.16 
 
 
321 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  43.43 
 
 
451 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  40.91 
 
 
360 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  44.32 
 
 
320 aa  165  7e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  41.53 
 
 
297 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  41.54 
 
 
318 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  41.95 
 
 
316 aa  153  3e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  35.17 
 
 
340 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  41.89 
 
 
327 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  40 
 
 
323 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4294  putative integral membrane protein  34.51 
 
 
348 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2552  hypothetical protein  38.33 
 
 
306 aa  119  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  22.83 
 
 
308 aa  61.6  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5232  hypothetical protein  26.13 
 
 
293 aa  59.3  9e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  27.19 
 
 
316 aa  56.6  5e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  20.83 
 
 
318 aa  55.8  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4939  hypothetical protein  22.22 
 
 
305 aa  52  1e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0759  hypothetical protein  26.53 
 
 
316 aa  51.6  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2712  hypothetical protein  20.33 
 
 
302 aa  50.8  3e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0129  hypothetical protein  26.44 
 
 
301 aa  49.3  8e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43686  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  20.75 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05451  hypothetical protein  20 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05441  hypothetical protein  20.16 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180339  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0667  hypothetical protein  25.52 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  0.807997 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04891  hypothetical protein  21.55 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.879079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  40.35 
 
 
316 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0238  hypothetical protein  21.18 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>