17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1339 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1339  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  200  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0087  PilT protein domain protein  56.34 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10307  hypothetical protein  57.14 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000112369  normal  0.0967595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2779  PilT protein domain protein  45.95 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7130  PilT domain-containing protein  45.21 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  39.44 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  52.46 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0935  PilT protein domain protein  50 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.827464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2785  PilT protein domain protein  46.55 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.030495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5190  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.745864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  44.16 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0521  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.281693  normal  0.161001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7412  hypothetical protein  46.67 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5559  PilT domain-containing protein  48.28 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.966422  normal  0.472394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4093  PilT protein domain-containing protein  54 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8949  hypothetical protein  58.54 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234545  normal  0.589918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4362  PilT protein domain protein  39.29 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>