242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1323 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1323  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 879 aa  1739    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133852 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0974  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.63 
 
 		 955 aa  737    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000578394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2554  phosphoenolpyruvate carboxylase  70.05 
 
 		 875 aa  1092    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0748469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3940  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.94 
 
 		 908 aa  1104    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.622429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0701  phosphoenolpyruvate carboxylase  78.03 
 
 		 890 aa  1314    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.8 
 
 		 892 aa  1080    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  58.78 
 
 		 900 aa  931    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2735  Phosphoenolpyruvate carboxylase  60.99 
 
 		 888 aa  888    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0956137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2248  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.05 
 
 		 891 aa  834    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.182119  hitchhiker  0.000536821 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2973  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.97 
 
 		 927 aa  718    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  63.47 
 
 		 915 aa  988    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0018  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  45.93 
 
 		 918 aa  700    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0134547 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1398  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.1 
 
 		 917 aa  744    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3285  Phosphoenolpyruvate carboxylase  56.32 
 
 		 913 aa  849    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.8 
 
 		 931 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.16 
 
 		 906 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.39 
 
 		 929 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.38 
 
 		 938 aa  489  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.81 
 
 		 952 aa  485  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 939 aa  482  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.97 
 
 		 907 aa  482  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.91 
 
 		 1002 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.36 
 
 		 933 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.5 
 
 		 1009 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 		 1001 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 		 985 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.39 
 
 		 918 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.89 
 
 		 1006 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 957 aa  452  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.99 
 
 		 929 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.99 
 
 		 929 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.85 
 
 		 896 aa  452  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 		 954 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.3 
 
 		 929 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 950 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.75 
 
 		 882 aa  446  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.11 
 
 		 942 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 		 947 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.69 
 
 		 914 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.37 
 
 		 896 aa  442  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.51 
 
 		 1023 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.86 
 
 		 903 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.65 
 
 		 946 aa  439  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.48 
 
 		 932 aa  439  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.77 
 
 		 945 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.28 
 
 		 883 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.48 
 
 		 1017 aa  439  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.51 
 
 		 972 aa  438  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.66 
 
 		 928 aa  438  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.24 
 
 		 896 aa  436  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.22 
 
 		 1088 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.76 
 
 		 1030 aa  436  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.43 
 
 		 981 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.16 
 
 		 920 aa  435  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.62 
 
 		 940 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 		 937 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.33 
 
 		 930 aa  435  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 		 1075 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 		 900 aa  432  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.5 
 
 		 1017 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.15 
 
 		 929 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.49 
 
 		 994 aa  432  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.14 
 
 		 926 aa  432  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.76 
 
 		 936 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 		 947 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.27 
 
 		 1018 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.25 
 
 		 994 aa  429  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.25 
 
 		 1085 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.73 
 
 		 937 aa  428  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.69 
 
 		 933 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.05 
 
 		 951 aa  428  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.25 
 
 		 994 aa  429  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.01 
 
 		 1021 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.58 
 
 		 934 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.25 
 
 		 994 aa  429  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.25 
 
 		 994 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.25 
 
 		 1024 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.25 
 
 		 994 aa  429  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.94 
 
 		 928 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.67 
 
 		 970 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.12 
 
 		 933 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.77 
 
 		 929 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.06 
 
 		 1038 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.93 
 
 		 949 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.98 
 
 		 898 aa  422  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.31 
 
 		 898 aa  422  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.69 
 
 		 998 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.07 
 
 		 982 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.72 
 
 		 998 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 		 928 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.51 
 
 		 1004 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.51 
 
 		 994 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 946 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.84 
 
 		 954 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.51 
 
 		 1009 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 946 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.83 
 
 		 949 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 946 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.87 
 
 		 938 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.51 
 
 		 1009 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>