34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1310 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  100 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  47.83 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0675  TadE family protein  56 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1733  hypothetical protein  32.76 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0064248  normal  0.12114 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  28.23 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3130  hypothetical protein  34.75 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  30.48 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3423  TadE family protein  50.98 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6890  hypothetical protein  32.76 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.011863  normal  0.687718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  28.93 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  38.89 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  39.62 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  39.62 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  36.36 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  41.38 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  29.73 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  32.89 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  32.84 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  32.91 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  30.86 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  32.79 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8207  TadE family protein  31.85 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  31.82 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0838  TadE family protein  29.46 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0630609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1545  hypothetical protein  31.4 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  42 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  38.78 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  23.66 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2479  TadE family protein  27.1 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  33.93 
 
 		 148 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  31.15 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  33.33 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  33.9 
 
 		 278 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>