203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1288 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  64.99 
 
 
765 aa  1001    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  75.95 
 
 
760 aa  1175    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  100 
 
 
765 aa  1543    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  38.58 
 
 
757 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  38.17 
 
 
764 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  39.97 
 
 
764 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  39.61 
 
 
779 aa  459  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  42.03 
 
 
774 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  42.13 
 
 
749 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  40.65 
 
 
681 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  40.1 
 
 
777 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  42.8 
 
 
775 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  34.86 
 
 
770 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  42.31 
 
 
772 aa  435  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  41.52 
 
 
780 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  40.5 
 
 
771 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  41.39 
 
 
760 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  38.98 
 
 
772 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  38.99 
 
 
772 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  39.02 
 
 
772 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  38.2 
 
 
775 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  38.89 
 
 
772 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  38.89 
 
 
772 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  38.17 
 
 
794 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  38.93 
 
 
772 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  38.83 
 
 
804 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  38.85 
 
 
772 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  40.5 
 
 
772 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  40.7 
 
 
772 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  38.92 
 
 
772 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  40.7 
 
 
772 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  40.18 
 
 
766 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  34.98 
 
 
799 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  40.5 
 
 
772 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  40.5 
 
 
772 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  40.5 
 
 
772 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  35.44 
 
 
775 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  37.67 
 
 
763 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  44.51 
 
 
763 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  34.98 
 
 
780 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  37.48 
 
 
795 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  40.61 
 
 
712 aa  394  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  40.61 
 
 
823 aa  393  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  38.76 
 
 
760 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  41.32 
 
 
778 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 
695 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  34.7 
 
 
828 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  32.32 
 
 
784 aa  316  9.999999999999999e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  29.14 
 
 
752 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  29.54 
 
 
836 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  29 
 
 
777 aa  303  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  33.87 
 
 
801 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  33.19 
 
 
803 aa  301  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  33.77 
 
 
779 aa  299  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  30.48 
 
 
770 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  34.96 
 
 
779 aa  291  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  32.4 
 
 
779 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.49 
 
 
752 aa  278  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  30 
 
 
797 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  27.3 
 
 
799 aa  274  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  28.85 
 
 
821 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  33.21 
 
 
816 aa  269  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  30.28 
 
 
776 aa  265  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  30.43 
 
 
1024 aa  264  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  30.43 
 
 
785 aa  263  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  29.61 
 
 
792 aa  261  4e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  30.11 
 
 
768 aa  257  5e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  27.77 
 
 
755 aa  253  7e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.91 
 
 
794 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  30.72 
 
 
803 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  29.66 
 
 
743 aa  248  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  32.43 
 
 
821 aa  247  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  31.36 
 
 
813 aa  247  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  30.12 
 
 
798 aa  246  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.47 
 
 
788 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  30.72 
 
 
803 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  27.81 
 
 
839 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  31.66 
 
 
788 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  29.43 
 
 
825 aa  241  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  25.07 
 
 
746 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  33.49 
 
 
828 aa  238  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
795 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  31.01 
 
 
795 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  31.48 
 
 
788 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  29.73 
 
 
791 aa  236  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  31.36 
 
 
803 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  31.57 
 
 
787 aa  236  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
806 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
806 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  31.53 
 
 
806 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  30.54 
 
 
791 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  31.17 
 
 
806 aa  231  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  28.33 
 
 
783 aa  231  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  30.54 
 
 
791 aa  231  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  26.57 
 
 
836 aa  230  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  28.67 
 
 
784 aa  230  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  36.84 
 
 
608 aa  230  8e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  31.35 
 
 
806 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  31.07 
 
 
790 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
806 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>