More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1252 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  82.84 
 
 		 373 aa  641    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 		 373 aa  766    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  51.63 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  50 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  50 
 
 		 372 aa  345  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  47.88 
 
 		 378 aa  344  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  48.26 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  48.53 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  48.26 
 
 		 371 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  47.97 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  47.97 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  47.97 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  47.97 
 
 		 382 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  47.97 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  47.97 
 
 		 382 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  48.26 
 
 		 382 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  47.97 
 
 		 371 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.74 
 
 		 430 aa  335  7e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  47.43 
 
 		 386 aa  335  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.16 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  46.49 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  46.76 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  46.76 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.91 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.65 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.34 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.06 
 
 		 379 aa  318  7e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  43.35 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.69 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  44.65 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0072  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.41 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  44.05 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  44.05 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.78 
 
 		 378 aa  310  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.69 
 
 		 380 aa  306  3e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  42.97 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  39.89 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.82 
 
 		 380 aa  299  5e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.97 
 
 		 374 aa  299  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  43.65 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  44.38 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  43.24 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3630  methylcitrate synthase  43.48 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0314  methylcitrate synthase  43.48 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2288  2-methylcitrate synthase  43.9 
 
 		 375 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.037213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  44.38 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1765  methylcitrate synthase  43.36 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.924616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.63 
 
 		 374 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  43.21 
 
 		 375 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  43.51 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1936  methylcitrate synthase  43.36 
 
 		 375 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686847  hitchhiker  0.000000858753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.93 
 
 		 377 aa  295  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3826  methylcitrate synthase  42.93 
 
 		 375 aa  295  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4723  methylcitrate synthase  42.66 
 
 		 375 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.18 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3435  methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 375 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01089  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2335  methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 375 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218689  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53950  methylcitrate synthase  42.39 
 
 		 375 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  42.44 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1776  methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 375 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549839  hitchhiker  0.000461346 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1420  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.85 
 
 		 374 aa  292  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.67 
 
 		 390 aa  292  7e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1176  2-methylcitrate synthase  41.67 
 
 		 372 aa  292  8e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.831059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0820  2-methylcitrate synthase  41.67 
 
 		 372 aa  292  8e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  42.7 
 
 		 396 aa  291  9e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0953  methylcitrate synthase  43.63 
 
 		 377 aa  291  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  44.05 
 
 		 473 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.64 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.96 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  43.24 
 
 		 397 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  42.66 
 
 		 375 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  42.93 
 
 		 376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1071  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.28 
 
 		 373 aa  289  6e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.66322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02396  methylcitrate synthase  42.28 
 
 		 380 aa  288  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003389  2-methylcitrate synthase  43.09 
 
 		 380 aa  288  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  41.11 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2420  2-methylcitrate synthase  40.58 
 
 		 375 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0822163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.74 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  43.82 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4141  methylcitrate synthase  41.85 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1665  methylcitrate synthase  42.28 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  43.58 
 
 		 378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4048  methylcitrate synthase  41.85 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4022  methylcitrate synthase  41.85 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  41.38 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3946  methylcitrate synthase  41.85 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.09 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3645  methylcitrate synthase  41.85 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2321  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  41.03 
 
 		 384 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  41.89 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  40.85 
 
 		 375 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0109  citrate synthase  44.72 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.373645  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3295  methylcitrate synthase  41.78 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  40.64 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  40.64 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  40.64 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  40.64 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0383  methylcitrate synthase  40.64 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679335  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  40.64 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>