More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1154 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  100 
 
 
103 aa  202  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  96.08 
 
 
104 aa  196  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  86.41 
 
 
103 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  80.58 
 
 
103 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  85.44 
 
 
101 aa  165  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  83.5 
 
 
102 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  84.47 
 
 
101 aa  163  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  80.58 
 
 
102 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  78.35 
 
 
100 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  78.57 
 
 
100 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  78.35 
 
 
100 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  76.7 
 
 
102 aa  157  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  79.61 
 
 
104 aa  156  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  76.29 
 
 
127 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  76.29 
 
 
127 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  80.77 
 
 
102 aa  154  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  76.29 
 
 
127 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  82.47 
 
 
98 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  79.38 
 
 
98 aa  152  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  79.17 
 
 
97 aa  148  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  74.23 
 
 
98 aa  148  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  78.35 
 
 
98 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 
97 aa  146  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  75.79 
 
 
98 aa  144  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  77.08 
 
 
97 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  75.51 
 
 
97 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
98 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  74.49 
 
 
97 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  73.2 
 
 
99 aa  140  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  74.23 
 
 
98 aa  140  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  72.16 
 
 
99 aa  140  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  73.68 
 
 
97 aa  138  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  75.79 
 
 
97 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  74.74 
 
 
97 aa  137  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
98 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  72.04 
 
 
97 aa  136  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  66.33 
 
 
99 aa  127  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  65.26 
 
 
97 aa  123  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
97 aa  121  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 
97 aa  120  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 
94 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  59.18 
 
 
98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  116  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  57.14 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 
94 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  61.7 
 
 
96 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 
94 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 
96 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  57.73 
 
 
96 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2276  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
94 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  59.14 
 
 
103 aa  110  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2574  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
94 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  59.34 
 
 
103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  54.46 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  56.7 
 
 
96 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0969  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18371  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
103 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0505  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
103 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.31516  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 
103 aa  107  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 
95 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  57.73 
 
 
92 aa  107  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
103 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  58.24 
 
 
103 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
103 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16391  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
103 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15561  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
103 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
97 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
98 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 
96 aa  107  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  59.18 
 
 
100 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
104 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2170  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
103 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
95 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16271  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
103 aa  105  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
95 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>