86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1152 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  771    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  52.33 
 
 		 423 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  49.88 
 
 		 428 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  54.52 
 
 		 415 aa  344  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  54.2 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  44.72 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  50.37 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  46.52 
 
 		 400 aa  265  8.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  49.56 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  44.2 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  40.4 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  45.2 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  45.64 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  41.29 
 
 		 412 aa  244  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  41.09 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  42.48 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  44.07 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  42.86 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  40.64 
 
 		 414 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  49.14 
 
 		 411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  36.22 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  36.54 
 
 		 477 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  40.56 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  37.12 
 
 		 487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  39.45 
 
 		 382 aa  172  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  40.17 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  34.38 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  37.32 
 
 		 443 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  39.88 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  39.88 
 
 		 412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  39.88 
 
 		 412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  34.92 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  37.61 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  36.54 
 
 		 399 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  37.68 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  35.37 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  34.4 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  27.48 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  29.05 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  26.79 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  26.2 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  26.84 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  25.54 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  27.44 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  24.94 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  24.49 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  23.88 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  20.43 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  21.79 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  21.5 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  23.87 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  22.35 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  42.47 
 
 		 438 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  39.74 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.63 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58562  predicted protein  27.14 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0813846  normal  0.776229 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  35.05 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 199 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  32.98 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  35.64 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  41.33 
 
 		 286 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  37.97 
 
 		 270 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  39.74 
 
 		 376 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  24.65 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  39.08 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  39.08 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  33.33 
 
 		 200 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.43 
 
 		 424 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  40 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  38.89 
 
 		 342 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  42.5 
 
 		 275 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 248 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  39.73 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2751  methyltransferase small  39.51 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.54 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  29.47 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  42.47 
 
 		 226 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  39.29 
 
 		 443 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.94 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  44.59 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  28.1 
 
 		 289 aa  43.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  41.33 
 
 		 214 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1885  protein of unknown function Met10  31.58 
 
 		 288 aa  42.7  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>