More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1125 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  80.95 
 
 
147 aa  258  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  77.55 
 
 
147 aa  254  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  77.55 
 
 
149 aa  251  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  76.19 
 
 
149 aa  248  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  77.55 
 
 
147 aa  247  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  77.55 
 
 
147 aa  247  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  76.87 
 
 
147 aa  244  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  75.51 
 
 
149 aa  242  1e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  74.15 
 
 
147 aa  241  2e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  74.83 
 
 
147 aa  239  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  74.83 
 
 
147 aa  237  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  74.83 
 
 
147 aa  236  7e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  74.15 
 
 
147 aa  235  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  74.15 
 
 
147 aa  234  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  72.79 
 
 
147 aa  233  6e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  75.17 
 
 
149 aa  233  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 
147 aa  228  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  73.47 
 
 
150 aa  228  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 
147 aa  226  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 
147 aa  226  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 
147 aa  225  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 
147 aa  224  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  69.39 
 
 
147 aa  223  5e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 
147 aa  223  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  67.35 
 
 
147 aa  218  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 
147 aa  215  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 
147 aa  211  2e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 
147 aa  212  2e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 
147 aa  212  2e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  66.67 
 
 
147 aa  209  9e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 
142 aa  208  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.18525e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 
142 aa  208  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  65.99 
 
 
147 aa  206  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  69.06 
 
 
143 aa  204  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.56517e-13  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  66.9 
 
 
144 aa  203  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.60952e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 
147 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 
147 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 
147 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  64.86 
 
 
148 aa  201  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  66.9 
 
 
142 aa  198  2e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.31451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  61.22 
 
 
149 aa  194  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  60.69 
 
 
145 aa  193  7e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-05  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  59.86 
 
 
145 aa  192  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  1.19852e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  192  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.75017e-09  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  61.81 
 
 
154 aa  192  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  191  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  1.30449e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
144 aa  192  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  4.19018e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  58.5 
 
 
149 aa  190  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  190  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  9.8694e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
144 aa  190  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  190  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.2865e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
176 aa  190  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  5.10805e-07  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
161 aa  189  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  7.734e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  189  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.78048e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.57129e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  1.8745e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
176 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.56516e-10  hitchhiker  4.50928e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  64.23 
 
 
144 aa  189  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.57006e-06  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.15689e-12  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  188  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  60.87 
 
 
148 aa  188  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  1.57584e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
144 aa  187  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  3.9802e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  187  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  62.77 
 
 
148 aa  187  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  9.65518e-09  hitchhiker  9.92925e-11 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
142 aa  187  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 
149 aa  186  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.00491e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 
149 aa  186  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  59.57 
 
 
145 aa  185  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  3.50375e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 
146 aa  185  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  184  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  1.37696e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
142 aa  184  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  184  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  63.57 
 
 
145 aa  184  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  60.58 
 
 
142 aa  184  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
143 aa  183  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.18039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 
144 aa  183  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 
144 aa  183  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  58.62 
 
 
146 aa  183  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
143 aa  182  1e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0055  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
146 aa  182  1e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00159664  normal  0.826314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
142 aa  182  2e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  57.24 
 
 
151 aa  182  2e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 
142 aa  182  2e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  6.79553e-07  normal  0.257999 
 
 
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
146 aa  181  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
149 aa  181  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  56.25 
 
 
150 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  54.23 
 
 
142 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>