More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1068 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  100 
 
 
266 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  79.29 
 
 
238 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  74.88 
 
 
250 aa  314  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  74.02 
 
 
280 aa  310  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  68.91 
 
 
246 aa  300  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  69.15 
 
 
272 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  67.48 
 
 
267 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  60.66 
 
 
273 aa  288  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  68.34 
 
 
266 aa  285  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  63.81 
 
 
276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  57.41 
 
 
306 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  68.59 
 
 
273 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  58.59 
 
 
272 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  61.89 
 
 
265 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  58.82 
 
 
270 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  58.82 
 
 
270 aa  274  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  63.94 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  67.72 
 
 
277 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  63.48 
 
 
228 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  62.68 
 
 
271 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  60.61 
 
 
242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  57.54 
 
 
266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  53.36 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  58.56 
 
 
320 aa  265  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  63.32 
 
 
242 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  62.38 
 
 
299 aa  264  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  58.82 
 
 
301 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  62.81 
 
 
287 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  56.33 
 
 
296 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  62.66 
 
 
255 aa  256  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  60.66 
 
 
269 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  62.76 
 
 
267 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  66.15 
 
 
262 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  52.47 
 
 
275 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3162  NusG antitermination factor  65.64 
 
 
259 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  54.59 
 
 
317 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  46.83 
 
 
243 aa  208  7e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  52.78 
 
 
176 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  51.69 
 
 
175 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  53.37 
 
 
175 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1622  transcription antiterminator  50.75 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000761547  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  50.75 
 
 
298 aa  194  9e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  52.25 
 
 
175 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  50.27 
 
 
178 aa  192  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  49.44 
 
 
178 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  50.55 
 
 
181 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  48.04 
 
 
176 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  48.6 
 
 
188 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  48.31 
 
 
187 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  48.09 
 
 
181 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  44.1 
 
 
203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  47.19 
 
 
194 aa  181  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  50.84 
 
 
173 aa  181  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  47.49 
 
 
174 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  48.62 
 
 
177 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  46.63 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  49.2 
 
 
185 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  47.75 
 
 
177 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  46.93 
 
 
201 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  47.19 
 
 
177 aa  175  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  47.75 
 
 
177 aa  175  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  46.7 
 
 
183 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  49.16 
 
 
175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  46.63 
 
 
180 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  49.73 
 
 
185 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  49.17 
 
 
177 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  46.96 
 
 
182 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  43.96 
 
 
178 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  46.96 
 
 
182 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  46.96 
 
 
182 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  48.62 
 
 
177 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  48.62 
 
 
177 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  48.62 
 
 
177 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  48.62 
 
 
177 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  48.62 
 
 
177 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  48.62 
 
 
177 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  48.62 
 
 
177 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  48.62 
 
 
177 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  49.17 
 
 
177 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  45.81 
 
 
175 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  46.37 
 
 
172 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  45 
 
 
174 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  43.72 
 
 
177 aa  168  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  47.51 
 
 
177 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  46.93 
 
 
176 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  46.07 
 
 
185 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 
176 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  45.51 
 
 
177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 
176 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  43.26 
 
 
173 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  43.26 
 
 
173 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  44.38 
 
 
176 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 
176 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  43.26 
 
 
176 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  44.38 
 
 
176 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  44.69 
 
 
190 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  44.13 
 
 
199 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  41.3 
 
 
178 aa  159  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  44.13 
 
 
185 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  44.13 
 
 
185 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>