More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1042 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  100 
 
 		 498 aa  942    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  66.01 
 
 		 482 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  53.9 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.35 
 
 		 763 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.55 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 		 519 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.65 
 
 		 487 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  41.27 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.86 
 
 		 498 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.08 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.88 
 
 		 527 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  39.87 
 
 		 492 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 		 494 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.61 
 
 		 489 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 474 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  39.39 
 
 		 454 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.72 
 
 		 487 aa  233  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.14 
 
 		 500 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  38.46 
 
 		 489 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 		 485 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  35.65 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.82 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  36.76 
 
 		 472 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.27 
 
 		 501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  38.02 
 
 		 489 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.68 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 478 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 508 aa  213  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5374  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.558764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 500 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.26 
 
 		 493 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.64 
 
 		 788 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  39.14 
 
 		 463 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 507 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 487 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3892  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.78 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 513 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  34.96 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.96 
 
 		 534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 481 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.82 
 
 		 496 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 507 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.52 
 
 		 522 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 553 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 486 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 502 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 518 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 		 534 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 478 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 484 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 478 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3744  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 484 aa  192  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.6 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 		 505 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.02 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  35.84 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.42 
 
 		 482 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 		 494 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 		 482 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 		 482 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 487 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  35.28 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.34 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.83 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 		 478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  37.03 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  35.81 
 
 		 492 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  31.36 
 
 		 470 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.32 
 
 		 502 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.32 
 
 		 528 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.46 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.64 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 480 aa  181  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.19 
 
 		 1112 aa  180  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 		 479 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 		 479 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>