More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1002 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  100 
 
 		 516 aa  989    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  61.1 
 
 		 492 aa  528  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 490 aa  350  4e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 562 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 588 aa  296  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 524 aa  287  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 575 aa  287  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 		 521 aa  286  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 513 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 514 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 517 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 501 aa  282  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 526 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 		 528 aa  280  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 529 aa  279  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 528 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.38 
 
 		 537 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  42.68 
 
 		 554 aa  273  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 540 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 533 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 		 539 aa  266  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 558 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 516 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 525 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  41.14 
 
 		 525 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 525 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  39.36 
 
 		 508 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 536 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 553 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 		 496 aa  256  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 497 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 584 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  38.51 
 
 		 535 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 508 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 514 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  38.51 
 
 		 535 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 502 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 		 519 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 509 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 601 aa  243  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 516 aa  242  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  40.63 
 
 		 477 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  39.44 
 
 		 505 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 563 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 536 aa  228  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  35.7 
 
 		 517 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.64 
 
 		 525 aa  223  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 504 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.39 
 
 		 534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 		 538 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 500 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 500 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 503 aa  203  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  37.95 
 
 		 528 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 516 aa  200  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 511 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 514 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 519 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  33.98 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 		 478 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.97 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.97 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 		 626 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.35 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  33.77 
 
 		 501 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.11 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 515 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  32.43 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>