More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0949 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
175 aa  352  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  65.79 
 
 
145 aa  181  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  77.68 
 
 
145 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  65.18 
 
 
277 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  60.16 
 
 
325 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  68.87 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  61.02 
 
 
233 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  65.74 
 
 
128 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  65.42 
 
 
141 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  64.42 
 
 
128 aa  137  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  57.41 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  61.32 
 
 
176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  58.04 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  58.04 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  54.35 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  58.04 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  60.58 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  60.55 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  58.49 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  59.05 
 
 
191 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  59.05 
 
 
191 aa  124  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  55.83 
 
 
128 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 
183 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  49.07 
 
 
156 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  43.81 
 
 
117 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  37.08 
 
 
133 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  39.33 
 
 
133 aa  57.8  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 
133 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 
250 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  28.1 
 
 
132 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
99 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 
105 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
228 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 
191 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  43.64 
 
 
104 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  32.93 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  44.83 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  44.83 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
130 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  32.93 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
252 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  44.83 
 
 
236 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  32.93 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  44.83 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  32.93 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  44.83 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
245 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  44.83 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  44.83 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  44.83 
 
 
236 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
193 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 
256 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
72 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  37.97 
 
 
115 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000123712  unclonable  0.0000012964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
205 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
76 aa  48.5  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  40.74 
 
 
108 aa  48.5  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
77 aa  48.5  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
71 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
76 aa  48.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  31.71 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 
223 aa  48.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
185 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
200 aa  47.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1676  gp68  44 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  49.09 
 
 
107 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  49.09 
 
 
107 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  49.09 
 
 
107 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  49.09 
 
 
107 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  49.09 
 
 
107 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  49.09 
 
 
107 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
185 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
109 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  43.1 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 
110 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  43.08 
 
 
187 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 
131 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
185 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.634753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>