More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0923 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  665    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  65.43 
 
 		 334 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  56.6 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  50.49 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  50.15 
 
 		 362 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 342 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  47.81 
 
 		 334 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  48.39 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  47.04 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  49.5 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  46.71 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  48.94 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  46.71 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 350 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 349 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 320 aa  271  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.84 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  47.57 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  46.27 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  45.25 
 
 		 331 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  46.93 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  45.03 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  46.91 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 333 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  47.72 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  48.04 
 
 		 356 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  47.35 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  44.38 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  42.41 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  46.38 
 
 		 348 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  46.03 
 
 		 317 aa  255  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  46.95 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  43.34 
 
 		 347 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  45.72 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  47.22 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  44.04 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  49.19 
 
 		 325 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  49.34 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  51.32 
 
 		 339 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  46.53 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  47.7 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  43.42 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  42.33 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  44.88 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  43.93 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  42.76 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  45.23 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  39.68 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  43.46 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  42.28 
 
 		 329 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  41.45 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  45.72 
 
 		 338 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  45.34 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  46.41 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  43.89 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  46.58 
 
 		 352 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  44.72 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1996  transcriptional regulator  48.56 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  46.08 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  45.72 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  45.93 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  41.69 
 
 		 342 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  44.48 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  44.48 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  42.19 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  44.48 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  39.93 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  39.8 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  44.16 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 		 343 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  47.54 
 
 		 320 aa  229  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  40.53 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  45.87 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>