More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0874 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 117 aa  237  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  38.16 
 
 		 377 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 204 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  38.55 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  35.16 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  35.16 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 99 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  32.88 
 
 		 376 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 359 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3773  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.84 
 
 		 294 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 346 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2458  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 197 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 207 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 205 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  41.18 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 642 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 		 383 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.33 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4562  transcriptional regulator, XRE family  31 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  42.11 
 
 		 349 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  43.64 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  34.29 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 516 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2812  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  36.26 
 
 		 338 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 328 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.15 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  40.32 
 
 		 227 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  35.21 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  31.76 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4072  helix-turn-helix domain protein  34.29 
 
 		 380 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 304 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 220 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 208 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 208 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 208 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 266 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>