More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0840 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
370 aa  728    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
400 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  45.3 
 
 
413 aa  242  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  42.63 
 
 
436 aa  239  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.94 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  41.21 
 
 
391 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
395 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  40.05 
 
 
400 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  40.85 
 
 
467 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
426 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
404 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  38.3 
 
 
425 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  48.94 
 
 
403 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
416 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
483 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  41.46 
 
 
389 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
473 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
394 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  38.22 
 
 
398 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  44.41 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  41.56 
 
 
405 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  42.06 
 
 
343 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  44.07 
 
 
344 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
362 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
378 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
373 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  38.44 
 
 
392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  36.41 
 
 
370 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
375 aa  176  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
385 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  39.43 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  40 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.04 
 
 
362 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 
435 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
469 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  37.7 
 
 
367 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
469 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
406 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  38.44 
 
 
405 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
455 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
378 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
504 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  34.78 
 
 
477 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
470 aa  146  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  34.81 
 
 
459 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  37.25 
 
 
455 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  34.55 
 
 
592 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.68 
 
 
461 aa  142  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
357 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.532357  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
513 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.35 
 
 
469 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  35.47 
 
 
481 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  38.18 
 
 
508 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
498 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
490 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
459 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 
471 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  28.5 
 
 
386 aa  137  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
474 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.99 
 
 
461 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.67 
 
 
486 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  36.46 
 
 
476 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  32.11 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  28.92 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  35.74 
 
 
517 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  35.76 
 
 
475 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  31.45 
 
 
436 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
436 aa  133  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
377 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  31.45 
 
 
457 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  31.45 
 
 
457 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
450 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.31 
 
 
461 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  30.82 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.31 
 
 
461 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  29.24 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  40.3 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  33.45 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  33.11 
 
 
431 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  33.1 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  32.04 
 
 
379 aa  129  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
452 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
524 aa  129  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  32.81 
 
 
566 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
459 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  33.44 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  31.41 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
484 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
450 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.33 
 
 
499 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  30.24 
 
 
467 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>