More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0827 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  100 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.95 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  73.68 
 
 		 214 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.99 
 
 		 216 aa  255  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.74 
 
 		 222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  63.24 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.98 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.27 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.74 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  61.95 
 
 		 212 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.8 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.35 
 
 		 213 aa  225  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  57.84 
 
 		 207 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.35 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.64 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.64 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.92 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  55.61 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.62 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.59 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.49 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  56.1 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.2 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.76 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  45.81 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  47.14 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.12 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  45 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.4 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.91 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.42 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  44.19 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.91 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.95 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  45.62 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  42.53 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.62 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.78 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  43.96 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.14 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.34 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.32 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.27 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.17 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  43.48 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  44.88 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  42.73 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 234 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.02 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.2 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  42.38 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.26 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  47.34 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.89 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>