More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0824 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  100 
 
 		 306 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  67.56 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  66.11 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  65.67 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  61.02 
 
 		 322 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  59.87 
 
 		 303 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  65.44 
 
 		 314 aa  333  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  59.12 
 
 		 290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  55 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  56.67 
 
 		 322 aa  299  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  52.7 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  55.33 
 
 		 323 aa  285  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  53.25 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 300 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  52.61 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  47.54 
 
 		 319 aa  247  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  46.75 
 
 		 315 aa  247  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  49.83 
 
 		 388 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  57.6 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  45.7 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  46.38 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  46.51 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  42.14 
 
 		 304 aa  241  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  44.55 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  44.37 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  45.1 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  47.51 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  44.37 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  47.33 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  45.54 
 
 		 319 aa  232  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 313 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  42.57 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  44.19 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  44.19 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  44.52 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  43.85 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  44.85 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.19 
 
 		 308 aa  221  9e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.16 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  48.85 
 
 		 254 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  40.52 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  43.28 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  46.03 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  42.08 
 
 		 247 aa  215  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  39.53 
 
 		 326 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  38.94 
 
 		 311 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  41.29 
 
 		 310 aa  208  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  40.13 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  42.62 
 
 		 741 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  39.35 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  40.97 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  39.53 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  39.13 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  36.96 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.73 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  39.33 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  39.19 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  43.23 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.14 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  38.64 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  40.27 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  46.72 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  39.19 
 
 		 290 aa  195  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  40 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  40.2 
 
 		 756 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  37.42 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 301 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  40.13 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  39.49 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  40.13 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  46.98 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  38.71 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  44.89 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  41.1 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  40.13 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  38.38 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.54 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  47.96 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  37.66 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  37.58 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  37.58 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  39.8 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  42.79 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>