177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0812 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  100 
 
 
1200 aa  2398    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  46.56 
 
 
1213 aa  923    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  59.13 
 
 
1448 aa  1203    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.4 
 
 
795 aa  292  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.32 
 
 
1212 aa  248  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  30.62 
 
 
1091 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  31.57 
 
 
1085 aa  226  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.66 
 
 
1109 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  29.17 
 
 
1000 aa  199  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.02 
 
 
1410 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  32.69 
 
 
675 aa  192  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  32.63 
 
 
671 aa  188  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.08 
 
 
584 aa  187  9e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  60.42 
 
 
510 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  28.28 
 
 
1418 aa  171  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.78 
 
 
823 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  56.93 
 
 
933 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  26.83 
 
 
981 aa  147  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.18 
 
 
1001 aa  117  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3309  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.88 
 
 
208 aa  103  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.75 
 
 
729 aa  95.1  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.09 
 
 
685 aa  92  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  50.91 
 
 
614 aa  91.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  39.31 
 
 
433 aa  82  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  32.1 
 
 
857 aa  81.6  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  48.11 
 
 
608 aa  75.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.15 
 
 
929 aa  74.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  45.45 
 
 
1154 aa  72.4  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  47.31 
 
 
649 aa  71.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  50 
 
 
743 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  47.73 
 
 
2334 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.43 
 
 
6885 aa  68.9  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  45.45 
 
 
523 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  34.39 
 
 
2170 aa  65.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  42.53 
 
 
455 aa  63.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.94 
 
 
1158 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  42.53 
 
 
455 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  41.38 
 
 
455 aa  63.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  41.38 
 
 
455 aa  63.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  41.38 
 
 
455 aa  62.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  42.59 
 
 
703 aa  62.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  49.41 
 
 
543 aa  62.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  41.38 
 
 
455 aa  62.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  42.4 
 
 
561 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  45.45 
 
 
847 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  40.23 
 
 
455 aa  62  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  39.08 
 
 
455 aa  62  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  43.43 
 
 
1887 aa  61.6  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  41.76 
 
 
787 aa  61.6  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  46.84 
 
 
544 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  40.23 
 
 
455 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.31 
 
 
578 aa  60.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  43.96 
 
 
637 aa  60.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  24.78 
 
 
926 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.68 
 
 
1454 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  41.67 
 
 
667 aa  59.7  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  42.22 
 
 
749 aa  59.7  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  34.34 
 
 
850 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  39.26 
 
 
823 aa  59.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  40.82 
 
 
617 aa  59.3  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  39.08 
 
 
455 aa  59.3  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  50.57 
 
 
924 aa  59.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  43.02 
 
 
455 aa  58.9  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  53.57 
 
 
460 aa  58.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  48.19 
 
 
973 aa  58.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.9 
 
 
962 aa  58.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.61 
 
 
809 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  44.19 
 
 
1121 aa  57.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.39 
 
 
815 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  42.22 
 
 
660 aa  58.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.29 
 
 
953 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  42.7 
 
 
655 aa  57  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  34.56 
 
 
392 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  26.01 
 
 
861 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  38.93 
 
 
681 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  40.23 
 
 
458 aa  57.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  34.29 
 
 
449 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  48.84 
 
 
662 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  38.68 
 
 
762 aa  56.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  29.55 
 
 
571 aa  56.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  37.21 
 
 
752 aa  56.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  44.32 
 
 
1137 aa  55.8  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30.33 
 
 
1332 aa  56.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  36.72 
 
 
987 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  40.23 
 
 
459 aa  55.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  40.66 
 
 
854 aa  55.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  43.68 
 
 
1209 aa  55.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.12 
 
 
756 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.64 
 
 
674 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.04 
 
 
1321 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  36.78 
 
 
458 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  30.07 
 
 
1378 aa  54.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  41.3 
 
 
651 aa  53.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  31.98 
 
 
2122 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.86 
 
 
940 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.65 
 
 
755 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  40.66 
 
 
588 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  40.74 
 
 
680 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  37.08 
 
 
674 aa  53.5  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  38.37 
 
 
456 aa  54.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>