133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0800 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  100 
 
 
550 aa  1046    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  46.22 
 
 
527 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  46.58 
 
 
504 aa  301  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  45.94 
 
 
516 aa  293  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  45.33 
 
 
519 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  39.86 
 
 
609 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  39.09 
 
 
634 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  36.52 
 
 
554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  41.5 
 
 
501 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  35.62 
 
 
540 aa  210  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  38.61 
 
 
491 aa  209  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  47.29 
 
 
658 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  34.58 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  36.68 
 
 
511 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  34.9 
 
 
507 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  37.53 
 
 
487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  33.87 
 
 
508 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  36.93 
 
 
486 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  37.23 
 
 
474 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  37.23 
 
 
486 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  36.04 
 
 
480 aa  157  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  34.48 
 
 
483 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  31.56 
 
 
643 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  34.5 
 
 
488 aa  144  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  35.91 
 
 
611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  29.9 
 
 
501 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  26.97 
 
 
467 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  26.77 
 
 
561 aa  89.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  23.57 
 
 
493 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  28.18 
 
 
512 aa  78.2  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  23.2 
 
 
474 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.2 
 
 
470 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.58 
 
 
480 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  23.6 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.57 
 
 
486 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.09 
 
 
549 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  23.23 
 
 
471 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  30.99 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.87 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.43 
 
 
632 aa  70.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.41 
 
 
476 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  26.05 
 
 
486 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  21.7 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  27.35 
 
 
551 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  26.93 
 
 
494 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  21.76 
 
 
472 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  27.59 
 
 
489 aa  64.3  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  32.48 
 
 
195 aa  63.9  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  21.69 
 
 
453 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  23.89 
 
 
480 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  21.66 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  27.6 
 
 
575 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  36.36 
 
 
532 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  19.63 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  21.05 
 
 
471 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  29.19 
 
 
443 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  27.01 
 
 
476 aa  60.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  27.96 
 
 
449 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  21.33 
 
 
472 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  21.1 
 
 
472 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  21.1 
 
 
472 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.94 
 
 
472 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  29.15 
 
 
530 aa  57.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  27.97 
 
 
521 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  24.73 
 
 
575 aa  57.4  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  27.39 
 
 
646 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  30.53 
 
 
177 aa  55.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  29.37 
 
 
766 aa  54.7  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  39.24 
 
 
498 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  37.23 
 
 
164 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  28.71 
 
 
469 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  35.79 
 
 
165 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  24.23 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  36.59 
 
 
165 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  36.59 
 
 
165 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  36.59 
 
 
165 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  35.87 
 
 
193 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  40.24 
 
 
161 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  41.56 
 
 
159 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  26.46 
 
 
491 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  30.85 
 
 
619 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
186 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  30.65 
 
 
160 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  28.38 
 
 
547 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  40.51 
 
 
165 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  30.83 
 
 
171 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  25.2 
 
 
492 aa  50.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  35.06 
 
 
170 aa  50.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  34.88 
 
 
164 aa  50.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  40.98 
 
 
167 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  36.47 
 
 
172 aa  50.4  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  39.39 
 
 
177 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  50.4  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  32.37 
 
 
555 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  32 
 
 
579 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  28.42 
 
 
152 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  33.66 
 
 
196 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  36.61 
 
 
160 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  36.62 
 
 
193 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>