More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0786 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  44.51 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  42.06 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  43.54 
 
 		 226 aa  85.1  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2398  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.010674  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4093  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2446  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00126454  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  50.68 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.54 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  30.86 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 289 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  27.52 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>