More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0772 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 199 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  31.9 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  31.9 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  31.9 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  30.17 
 
 		 185 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  31.29 
 
 		 185 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2542  DNA-binding protein  30.06 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.93 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  31.93 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  31.93 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1555  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  34.1 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  35.06 
 
 		 652 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  31.93 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  31.93 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  31.93 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 642 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  27.49 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  31.33 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  28.42 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0945  transcriptional regulator, XRE family  27.61 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000133489  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  31.21 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  31.21 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1434  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.887851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  27.07 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  30.59 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  29.32 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  29.32 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  33.16 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  29.32 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  28.98 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  31.1 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  29.65 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4256  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.949593  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  29.55 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  29.55 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  29.55 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  29.55 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4285  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  32.7 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.77 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  33.75 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34730  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  0.262574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>