171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0745 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  367  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  71.12 
 
 
192 aa  258  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  76.33 
 
 
185 aa  254  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  71.58 
 
 
196 aa  251  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  67.72 
 
 
195 aa  244  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  65.57 
 
 
194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  66.49 
 
 
235 aa  229  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  60.75 
 
 
238 aa  210  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  56.91 
 
 
261 aa  203  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  55.68 
 
 
256 aa  203  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  55.5 
 
 
204 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  54.59 
 
 
231 aa  189  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  58.05 
 
 
197 aa  188  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  55.56 
 
 
216 aa  186  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  51.89 
 
 
216 aa  184  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  52.97 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  53.63 
 
 
213 aa  182  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  54.19 
 
 
218 aa  178  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  48.65 
 
 
215 aa  176  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  49.19 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  45.4 
 
 
302 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  45.36 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  45.36 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  45.56 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  40.44 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  39.36 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  40.98 
 
 
187 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  40.98 
 
 
205 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  38.42 
 
 
204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  37.57 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  38.62 
 
 
193 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  37.04 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  37.1 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  39.89 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  36.51 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  37.1 
 
 
192 aa  111  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  37.5 
 
 
190 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  36.76 
 
 
190 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  40.44 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  37.3 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  39.34 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  37.1 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  37.5 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  35.64 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  37.91 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  33.88 
 
 
194 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  37.97 
 
 
203 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  36.22 
 
 
194 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  36.56 
 
 
190 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  37.57 
 
 
196 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  36.52 
 
 
187 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  33.88 
 
 
184 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  36.67 
 
 
190 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  36.67 
 
 
190 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  36.22 
 
 
190 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  36.22 
 
 
218 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  36.67 
 
 
190 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  36.22 
 
 
190 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  36.67 
 
 
190 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  36.67 
 
 
190 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  36.67 
 
 
190 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  36.67 
 
 
190 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  35.68 
 
 
218 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  35.09 
 
 
184 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  36.22 
 
 
194 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  36.81 
 
 
201 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  35.48 
 
 
204 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  35.87 
 
 
194 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  35.68 
 
 
218 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  35.68 
 
 
218 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  37.16 
 
 
194 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  37.1 
 
 
184 aa  101  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  35.52 
 
 
189 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  35.33 
 
 
219 aa  101  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  34.46 
 
 
190 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  36.17 
 
 
187 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  34.46 
 
 
190 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  34.83 
 
 
200 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  35.42 
 
 
188 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  37.21 
 
 
192 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  36.17 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  34.76 
 
 
184 aa  99  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  36.61 
 
 
194 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  36.51 
 
 
191 aa  98.6  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  36.61 
 
 
194 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  38.12 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  34.04 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  38.92 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  35.52 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  37.02 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  37.13 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  34.1 
 
 
189 aa  96.3  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  34.55 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  35.67 
 
 
194 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  37.63 
 
 
191 aa  94.4  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  34.25 
 
 
191 aa  94.4  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  36.78 
 
 
196 aa  91.3  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  36.16 
 
 
185 aa  91.3  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  33.87 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  32.46 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>