153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0641 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 508 aa  970    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  39.41 
 
 		 509 aa  250  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  33.46 
 
 		 533 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  35.42 
 
 		 498 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  34.69 
 
 		 469 aa  183  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  29.63 
 
 		 503 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  30.41 
 
 		 490 aa  134  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  30.02 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 487 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  24.1 
 
 		 493 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 482 aa  94  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 483 aa  93.6  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 487 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 479 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 499 aa  90.1  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 475 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.2 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  26.52 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  24.79 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 504 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.81 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4129  polysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  23.54 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  23.54 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 520 aa  76.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  27.55 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  26.69 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  28.31 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.08 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  27.1 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  25.23 
 
 		 512 aa  72  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  24.86 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.74 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.74 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.74 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.74 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 467 aa  67  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.08 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  25.53 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  27.68 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  22.48 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.21 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  26.8 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  20.76 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  21.45 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  26.08 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  26.08 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  21.74 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 458 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3528  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000418203  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  21.74 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  21.74 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  21.74 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  21.74 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  21.48 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  18.78 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.21 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  21.74 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>