More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0631 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  100 
 
 
355 aa  703    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  68.36 
 
 
355 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  66.2 
 
 
356 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  65.35 
 
 
358 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  62.82 
 
 
355 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  58.52 
 
 
355 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  57.67 
 
 
355 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  57.1 
 
 
355 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.82 
 
 
355 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.31 
 
 
355 aa  384  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.77 
 
 
358 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.9 
 
 
357 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.28 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.63 
 
 
376 aa  335  5e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  46.93 
 
 
358 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.44 
 
 
354 aa  331  1e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.69 
 
 
357 aa  329  4e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.04 
 
 
355 aa  328  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.38 
 
 
357 aa  328  9e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.18 
 
 
355 aa  325  5e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.63 
 
 
357 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.88 
 
 
356 aa  324  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.7 
 
 
353 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.06 
 
 
357 aa  323  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.61 
 
 
355 aa  322  8e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.91 
 
 
355 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.41 
 
 
359 aa  318  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.34 
 
 
357 aa  316  3e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.79 
 
 
357 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.51 
 
 
357 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.78 
 
 
364 aa  315  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.31 
 
 
355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.74 
 
 
349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.81 
 
 
358 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.92 
 
 
344 aa  289  4e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.61 
 
 
354 aa  287  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.66 
 
 
355 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.1 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.9 
 
 
351 aa  251  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  34.46 
 
 
365 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1069  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.83 
 
 
296 aa  188  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.69912  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.28 
 
 
320 aa  185  9e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.42 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.44 
 
 
302 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40 
 
 
240 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.15 
 
 
353 aa  175  9e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.08 
 
 
292 aa  175  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.96 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.15 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1406  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.38 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0680028  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.63 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1726  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.4 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000315653  normal  0.563962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03410  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.96 
 
 
293 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401967  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4472  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.02 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0455332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.16 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0233159  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  33.93 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4180  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.61 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.112992  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.08 
 
 
289 aa  173  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.15 
 
 
397 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1914  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.02 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943889 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.08 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290033  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1007  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.33 
 
 
300 aa  172  9e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14400  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40 
 
 
300 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.856501  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1381  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.77 
 
 
292 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1919  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.16 
 
 
298 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0512  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  38.7 
 
 
295 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.17 
 
 
291 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.468388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0479  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.08 
 
 
293 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.778561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1894  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.4 
 
 
292 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284713  normal  0.0266706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  35.63 
 
 
400 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
292 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.02 
 
 
293 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  38.56 
 
 
270 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001807  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.78 
 
 
293 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
292 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  41.53 
 
 
235 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
292 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.89 
 
 
294 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2263  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.98 
 
 
305 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
292 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.37 
 
 
295 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3029  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.84 
 
 
291 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.31 
 
 
296 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03667  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.21 
 
 
293 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.21 
 
 
293 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4214  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.21 
 
 
293 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4132  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.21 
 
 
293 aa  169  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4300  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.21 
 
 
293 aa  169  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.671584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0555  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.18 
 
 
296 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4153  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.21 
 
 
293 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
294 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
290 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03616  hypothetical protein  37.21 
 
 
293 aa  169  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4006  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.21 
 
 
293 aa  169  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5222  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.98 
 
 
293 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
298 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
411 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
294 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 
396 aa  169  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.37 
 
 
292 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>