More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0533 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  81.06 
 
 
264 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  78.41 
 
 
267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  71.48 
 
 
268 aa  362  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.68 
 
 
276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  63.85 
 
 
270 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.69 
 
 
272 aa  308  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.07 
 
 
272 aa  307  9e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.98 
 
 
267 aa  305  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.32 
 
 
264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  64.62 
 
 
276 aa  298  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  63.46 
 
 
270 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.85 
 
 
264 aa  292  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.54 
 
 
270 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3315  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.85 
 
 
545 aa  286  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112509  normal  0.0752896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.7 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6140  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.95 
 
 
297 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179161  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.46 
 
 
267 aa  248  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.39 
 
 
279 aa  230  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 
274 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.36 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.7 
 
 
281 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0661  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.62 
 
 
294 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0681  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.62 
 
 
294 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128651  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.62 
 
 
294 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.37 
 
 
285 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 
276 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.13 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.68 
 
 
270 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 
270 aa  198  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1003  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.28 
 
 
281 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.04 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.15 
 
 
270 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.79 
 
 
280 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.36 
 
 
271 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 
270 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0075  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 
293 aa  191  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.46 
 
 
268 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.27 
 
 
274 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 
270 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
279 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 
274 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
279 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.27 
 
 
274 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0399  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.27 
 
 
274 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  42 
 
 
277 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10509  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 
295 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
279 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0837  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.65 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.60816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.93 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.94 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.6 
 
 
264 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
279 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2357  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
266 aa  182  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.4 
 
 
274 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 
275 aa  181  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
279 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
279 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 
272 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
279 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.51 
 
 
264 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 
267 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
269 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
272 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
269 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
269 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 
272 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  38.02 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.14 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
272 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.31 
 
 
275 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.54 
 
 
269 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 
272 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 
271 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  39 
 
 
267 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 
282 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  41 
 
 
270 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
269 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
269 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
272 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
269 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
269 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
269 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
271 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>