More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0460 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.34 
 
 
759 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  64.96 
 
 
737 aa  881    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  55.31 
 
 
1057 aa  716    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  63.08 
 
 
736 aa  853    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  100 
 
 
744 aa  1529    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  68.56 
 
 
739 aa  959    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  48.64 
 
 
773 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  46.53 
 
 
801 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.85 
 
 
747 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  43.18 
 
 
892 aa  547  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  43.17 
 
 
789 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  43.02 
 
 
820 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 
807 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  41.42 
 
 
740 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  40.63 
 
 
819 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  40.15 
 
 
880 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  39.86 
 
 
871 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  38.1 
 
 
821 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 
877 aa  399  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  38.08 
 
 
833 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  37.15 
 
 
784 aa  395  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  38.36 
 
 
758 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
758 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  36.01 
 
 
727 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.12 
 
 
705 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.02 
 
 
766 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.48 
 
 
763 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  38.4 
 
 
721 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  34.99 
 
 
765 aa  355  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  34.57 
 
 
807 aa  347  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 
766 aa  343  5.999999999999999e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.24 
 
 
727 aa  343  7e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  34.59 
 
 
771 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  36.22 
 
 
838 aa  339  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
723 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  35.26 
 
 
801 aa  336  9e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
808 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.14 
 
 
821 aa  335  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  34.46 
 
 
710 aa  330  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
710 aa  326  8.000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  35.17 
 
 
680 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  34.35 
 
 
726 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  34.24 
 
 
814 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  32.96 
 
 
772 aa  320  7.999999999999999e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  34.35 
 
 
693 aa  318  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.33 
 
 
817 aa  312  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  33.24 
 
 
773 aa  310  5e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.96 
 
 
720 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
703 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.34 
 
 
695 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  33.66 
 
 
830 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  37.64 
 
 
700 aa  298  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  33.07 
 
 
722 aa  295  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  31.31 
 
 
768 aa  294  3e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.24 
 
 
840 aa  294  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
828 aa  286  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
817 aa  286  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.82 
 
 
811 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
818 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  32.69 
 
 
761 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  33.33 
 
 
810 aa  281  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
816 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
816 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  34.13 
 
 
710 aa  278  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
830 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
816 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
831 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
831 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.86 
 
 
648 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  32.75 
 
 
806 aa  275  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.06 
 
 
816 aa  274  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
824 aa  274  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  35.33 
 
 
750 aa  273  8.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  32.07 
 
 
723 aa  263  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.68 
 
 
710 aa  261  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 
761 aa  260  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  32.58 
 
 
712 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1108  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
678 aa  256  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.3 
 
 
643 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.3 
 
 
643 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  31.83 
 
 
661 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  31.64 
 
 
719 aa  253  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
1245 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  31.83 
 
 
643 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.02 
 
 
727 aa  250  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  31.73 
 
 
905 aa  249  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  32.91 
 
 
824 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
1065 aa  248  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.06 
 
 
649 aa  248  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.7 
 
 
618 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  32.99 
 
 
776 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  32.59 
 
 
824 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  33.07 
 
 
836 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  33.49 
 
 
764 aa  242  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.36 
 
 
1129 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  34.01 
 
 
709 aa  241  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  31.69 
 
 
724 aa  241  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.32 
 
 
765 aa  239  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  29.13 
 
 
750 aa  239  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  30.19 
 
 
730 aa  239  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>