More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0436 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1513  Osmosensitive K channel His kinase sensor  55.94 
 
 
832 aa  812    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.919123  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1437  Osmosensitive K channel His kinase sensor  66.27 
 
 
854 aa  1066    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.429266  normal  0.268919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1707  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  49.65 
 
 
849 aa  721    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  100 
 
 
851 aa  1654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  53.66 
 
 
857 aa  783    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4089  Osmosensitive K channel His kinase sensor  50.54 
 
 
845 aa  709    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3803  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  86.67 
 
 
846 aa  1346    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109811  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5030  Osmosensitive K channel His kinase sensor  63.17 
 
 
815 aa  854    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3283  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  66.63 
 
 
854 aa  967    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331513  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0599  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  62.53 
 
 
938 aa  999    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3247  Osmosensitive K channel His kinase sensor  53.93 
 
 
853 aa  775    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27030  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  53.95 
 
 
853 aa  791    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.553859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  56.1 
 
 
836 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1878  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  50.23 
 
 
883 aa  733    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.759992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3228  Osmosensitive K channel His kinase sensor  56.06 
 
 
854 aa  798    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1019  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  56.55 
 
 
858 aa  796    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0833425  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  52.71 
 
 
860 aa  778    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  56.1 
 
 
836 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  53.68 
 
 
850 aa  788    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6794  Osmosensitive K channel His kinase sensor  60.89 
 
 
891 aa  934    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431431  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1955  Osmosensitive K channel His kinase sensor  52.75 
 
 
902 aa  770    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1632  Osmosensitive K channel His kinase sensor  58.77 
 
 
844 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0300  Osmosensitive K channel His kinase sensor  52.43 
 
 
850 aa  697    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  56.34 
 
 
836 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  37.43 
 
 
905 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
905 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
907 aa  492  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  38.36 
 
 
907 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  38.06 
 
 
885 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
912 aa  488  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
901 aa  485  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
907 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
888 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 
887 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 
887 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
902 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
905 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
907 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
902 aa  465  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  39.89 
 
 
905 aa  466  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
897 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  37.33 
 
 
902 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
892 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  36.72 
 
 
910 aa  452  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
895 aa  448  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
889 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
890 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  37.13 
 
 
895 aa  444  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
894 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
894 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
897 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
902 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  36.27 
 
 
902 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  36.87 
 
 
993 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
900 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  36.87 
 
 
993 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  36.87 
 
 
993 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
896 aa  419  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  36.42 
 
 
1035 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
897 aa  419  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  36.15 
 
 
906 aa  416  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
947 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  35.16 
 
 
910 aa  412  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  35.22 
 
 
909 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
867 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  34.69 
 
 
908 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
895 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  35.25 
 
 
908 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  34.69 
 
 
908 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  34.31 
 
 
895 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
894 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
867 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
944 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  34.2 
 
 
894 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
947 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  34.31 
 
 
894 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
947 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  34.09 
 
 
894 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5921  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
904 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  34.09 
 
 
894 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  35.61 
 
 
894 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
884 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  34.2 
 
 
894 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
884 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  35.62 
 
 
887 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  35.03 
 
 
894 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
944 aa  399  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  34.16 
 
 
895 aa  399  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  35.03 
 
 
894 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
947 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  35.03 
 
 
894 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
949 aa  399  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2201  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
945 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394396  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  34.87 
 
 
905 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
887 aa  396  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
884 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2323  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
945 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  33.98 
 
 
894 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0780  sensor histidine kinase KdpD  36.36 
 
 
954 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.795165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  34.61 
 
 
895 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>