54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0430 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  70.43 
 
 		 478 aa  694    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  100 
 
 		 475 aa  953    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  61.47 
 
 		 476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  47.02 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  48.72 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  41.15 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  41.36 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  41.51 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  40.33 
 
 		 541 aa  360  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  41.15 
 
 		 475 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  38.38 
 
 		 499 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  34.91 
 
 		 498 aa  286  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  28.07 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  21.9 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2888  L-arabinose isomerase  25.12 
 
 		 452 aa  90.1  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  22.79 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0382  L-arabinose isomerase  24.94 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1863  L-arabinose isomerase  25.05 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6217  L-arabinose isomerase  27.16 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  23.98 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1154  L-arabinose isomerase  23.76 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2397  L-arabinose isomerase  23.6 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2001  L-arabinose isomerase  22.06 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0873  L-arabinose isomerase  23.54 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1887  L-arabinose isomerase  22.06 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2243  L-arabinose isomerase  23.4 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000390243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2259  L-arabinose isomerase  21.86 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4713  L-arabinose isomerase  25 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0244  L-arabinose isomerase  23.54 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0054  L-arabinose isomerase  23.34 
 
 		 500 aa  50.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2027  L-arabinose isomerase  21.06 
 
 		 501 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.929629  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3203  L-arabinose isomerase  22.06 
 
 		 497 aa  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0609  L-arabinose isomerase  24 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.97882  normal  0.159934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1238  L-arabinose isomerase  21.41 
 
 		 496 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.112661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2327  L-arabinose isomerase  21.06 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.305098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0067  L-arabinose isomerase  23.19 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3595  L-arabinose isomerase  23.13 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0064  L-arabinose isomerase  23.13 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203815  normal  0.780498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0066  L-arabinose isomerase  23.13 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00063  hypothetical protein  23.13 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0064  L-arabinose isomerase  23.13 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0849875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00064  L-arabinose isomerase  23.13 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3537  L-arabinose isomerase  23.19 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0852  L-arabinose isomerase  21.65 
 
 		 474 aa  47.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2753  L-arabinose isomerase  23.83 
 
 		 502 aa  47.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0767064  decreased coverage  0.00000377093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2897  L-arabinose isomerase  22.78 
 
 		 494 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0106  L-arabinose isomerase  24.04 
 
 		 500 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2066  L-arabinose isomerase  19.67 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000180583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0113  L-arabinose isomerase  23.67 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06960  L-arabinose isomerase  22.87 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0109  L-arabinose isomerase  23.67 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.309204 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0108  L-arabinose isomerase  23.67 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0113  L-arabinose isomerase  23.67 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3996  L-arabinose isomerase  22.12 
 
 		 501 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0451143  normal  0.502282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>