156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0422 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  100 
 
 
415 aa  855    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  68.43 
 
 
414 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  67.71 
 
 
416 aa  566  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  68.61 
 
 
417 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  66.83 
 
 
418 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  65.12 
 
 
417 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  65.12 
 
 
417 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  64.88 
 
 
417 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  65.38 
 
 
417 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  65.22 
 
 
418 aa  541  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  62.91 
 
 
397 aa  536  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  63.09 
 
 
418 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  61.54 
 
 
408 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  61.54 
 
 
406 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  57.95 
 
 
410 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  58.44 
 
 
412 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  58.44 
 
 
412 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  58.68 
 
 
412 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  57.38 
 
 
409 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  62.76 
 
 
411 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  59.01 
 
 
409 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  57.78 
 
 
409 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  60.34 
 
 
408 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  58.87 
 
 
410 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  57.28 
 
 
409 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  57.67 
 
 
410 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  57.28 
 
 
409 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  56.83 
 
 
410 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  57.78 
 
 
409 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  57.53 
 
 
409 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  56.9 
 
 
410 aa  478  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  57.7 
 
 
409 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  57.82 
 
 
420 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  57.28 
 
 
409 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  58.19 
 
 
409 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  57.25 
 
 
410 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  56.83 
 
 
410 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  56.4 
 
 
410 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  57.46 
 
 
409 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  53.55 
 
 
451 aa  442  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  52.64 
 
 
411 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  51.9 
 
 
426 aa  422  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  50 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  46.72 
 
 
401 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  58.73 
 
 
206 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  39.55 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  34.6 
 
 
388 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  33.25 
 
 
459 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  31.66 
 
 
318 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  31.63 
 
 
328 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.53 
 
 
322 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  29.87 
 
 
319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  29.87 
 
 
319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  30.13 
 
 
319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  28.46 
 
 
312 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  28.46 
 
 
312 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.6 
 
 
315 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  26.01 
 
 
314 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  28.12 
 
 
313 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  30.53 
 
 
224 aa  99.8  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  26.95 
 
 
314 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  27.97 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  26.06 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  26.06 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  26.06 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  26.06 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.44 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  26.95 
 
 
791 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  25.46 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  29.03 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  28.18 
 
 
358 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  31.13 
 
 
481 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  31.4 
 
 
315 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  25.78 
 
 
311 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  26.04 
 
 
305 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  26.51 
 
 
310 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  24.78 
 
 
484 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  22.63 
 
 
439 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  31.51 
 
 
359 aa  60.1  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 
844 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  28.39 
 
 
491 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  27.52 
 
 
301 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  26.81 
 
 
485 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 
777 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  25.37 
 
 
479 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
791 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  27.8 
 
 
479 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  25.29 
 
 
304 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  28.64 
 
 
483 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  24.23 
 
 
304 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  31.94 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  31.48 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  24.12 
 
 
304 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  24.12 
 
 
304 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  24.12 
 
 
304 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  26.28 
 
 
775 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  29.41 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  24.51 
 
 
304 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  23.02 
 
 
303 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  30.59 
 
 
345 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>