More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0409 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  776    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  48.25 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  48.02 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 		 438 aa  359  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  52.54 
 
 		 443 aa  349  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 423 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  47.29 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  48.49 
 
 		 426 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  48.49 
 
 		 426 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 447 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  47.5 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  42.11 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  40.44 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 439 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  41.79 
 
 		 460 aa  246  4e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 		 423 aa  242  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  37.57 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 421 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  27.03 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  27.03 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  30.22 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  28.17 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  27.89 
 
 		 430 aa  99.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 434 aa  93.2  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 434 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 432 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  26.67 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 425 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  26.67 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  25.56 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  24.48 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  25.59 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  28.25 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  28.25 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  26.16 
 
 		 431 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  23.04 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  27.3 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  27.3 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  25.63 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  29.43 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  26.61 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  23.04 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  28.74 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  25.08 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  25.08 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  29.64 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  25.9 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  25.9 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  24.3 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  27.73 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  31.82 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  31.82 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  29.25 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  23.36 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  24.46 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  24.46 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  25.15 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  30.74 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  24.06 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  24.06 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  24.06 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  26.11 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  30.89 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>