More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0331 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  874    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  75.85 
 
 
439 aa  618  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  65.59 
 
 
442 aa  547  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  60.73 
 
 
506 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  60.53 
 
 
487 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  62 
 
 
468 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  60.42 
 
 
447 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  60.54 
 
 
446 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  61.72 
 
 
444 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  60.79 
 
 
444 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  58.66 
 
 
442 aa  497  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  59.81 
 
 
446 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  56.45 
 
 
437 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  54.78 
 
 
437 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  54.29 
 
 
436 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  54.29 
 
 
436 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  54.29 
 
 
436 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  55.07 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  53.29 
 
 
442 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  54.99 
 
 
448 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  53.29 
 
 
425 aa  398  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  47.14 
 
 
446 aa  352  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  40.65 
 
 
412 aa  302  8.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  39.04 
 
 
766 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  38.25 
 
 
417 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 
416 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
416 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  41.81 
 
 
424 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  33.18 
 
 
436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  32.67 
 
 
444 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  37.05 
 
 
414 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  37.59 
 
 
374 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  37 
 
 
374 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  34.4 
 
 
423 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  33.26 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  34.14 
 
 
427 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  33.74 
 
 
430 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  33.82 
 
 
429 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  29.64 
 
 
819 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  33.56 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  33.17 
 
 
425 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  31.57 
 
 
420 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  34.92 
 
 
439 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  35.11 
 
 
447 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  34.38 
 
 
374 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  35.03 
 
 
470 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  31.63 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  34.42 
 
 
425 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  30.75 
 
 
433 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  31.97 
 
 
437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  33.11 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  33.82 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  32.05 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  30.54 
 
 
438 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  31.67 
 
 
409 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  34.99 
 
 
434 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  34.44 
 
 
415 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  35.94 
 
 
430 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  34.42 
 
 
415 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  34.2 
 
 
415 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  33.41 
 
 
434 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  32.71 
 
 
437 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  32.87 
 
 
434 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  32.27 
 
 
412 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  30.77 
 
 
408 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  33.41 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  32.47 
 
 
433 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  33.93 
 
 
437 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  33.25 
 
 
426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  32.73 
 
 
430 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  33.64 
 
 
386 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  32.08 
 
 
385 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  33.56 
 
 
453 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  31.44 
 
 
432 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  30.27 
 
 
385 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  33.74 
 
 
425 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  33.63 
 
 
453 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  29.77 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  30.81 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  31.6 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  30.61 
 
 
386 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  31.36 
 
 
423 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  29.95 
 
 
422 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  33.65 
 
 
411 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  32.35 
 
 
384 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  31.86 
 
 
404 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  32.12 
 
 
383 aa  144  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  28.95 
 
 
398 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  31 
 
 
432 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  33.02 
 
 
433 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  31 
 
 
429 aa  143  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  31.59 
 
 
433 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  31.31 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  29.83 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  29.06 
 
 
415 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  28.51 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  33.65 
 
 
451 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  33.73 
 
 
411 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  30.75 
 
 
441 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  30.82 
 
 
393 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>