More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0303 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
426 aa  840    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  62.14 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  52.44 
 
 
403 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  48.18 
 
 
467 aa  332  8e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  47.91 
 
 
436 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  50.85 
 
 
413 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.47 
 
 
448 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 
416 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  42.08 
 
 
425 aa  282  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 
401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
483 aa  250  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  46.37 
 
 
362 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.55 
 
 
370 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  45.31 
 
 
343 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  45.6 
 
 
405 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  38.31 
 
 
391 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  41.71 
 
 
389 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
378 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  41.5 
 
 
389 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
473 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  37.65 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
394 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  43.75 
 
 
344 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
375 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.79 
 
 
362 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  42.47 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
373 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  40.13 
 
 
367 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.49 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  35.31 
 
 
370 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  40.85 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  43.69 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
469 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
469 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
378 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  33.17 
 
 
343 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  25.49 
 
 
461 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
504 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
470 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  35.46 
 
 
459 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
467 aa  136  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.52 
 
 
469 aa  136  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
490 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  34.33 
 
 
475 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
489 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.07 
 
 
486 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.47 
 
 
469 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
487 aa  132  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.48 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  34.36 
 
 
555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  33.23 
 
 
463 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
469 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
458 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  33.77 
 
 
452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
469 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  32.28 
 
 
592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  35.78 
 
 
508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  37.46 
 
 
583 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
537 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  33.58 
 
 
471 aa  126  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  28.85 
 
 
386 aa  126  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
469 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  33.17 
 
 
456 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  27.81 
 
 
472 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
480 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  33.22 
 
 
463 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  28.74 
 
 
483 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
504 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
389 aa  124  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
357 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.532357  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
467 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26830  signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
368 aa  123  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  32.97 
 
 
566 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  32.78 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  26.75 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  29.88 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  27.11 
 
 
436 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>