More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0296 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  891    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  53.32 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  53.96 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.73 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 495 aa  123  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 427 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  29.11 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 424 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.18 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 441 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 420 aa  97.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 431 aa  97.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.48 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 431 aa  90.5  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.21 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  21.17 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.31 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.02 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.13 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.4 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3472  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.72 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.1 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  25.32 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.2 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.36 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.84 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.71 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.71 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  31.52 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  21.39 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.26 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>