31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0273 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0273  phosphatase like to the domain of histone macroH2A1  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3377  Appr-1-p processing domain protein  36 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.590192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0008  appr-1-p processing domain-containing protein  35.93 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00352101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6708  Appr-1-p processing domain protein  33.33 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01180  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  34.94 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1996  appr-1-p processing domain-containing protein  30.89 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  33.72 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2793  appr-1-p processing enzyme family protein  35.59 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  41.23 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0560  Appr-1-p processing domain protein  37.61 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0099  Appr-1-p processing domain protein  29.24 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4662  Appr-1-p processing domain protein  36.25 
 
 		 175 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0064  Appr-1-p processing domain protein  29.17 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0212337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0952  hypothetical protein  39.58 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0689  Appr-1-p processing domain protein  36.25 
 
 		 170 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1101  hypothetical protein  27.81 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1407  appr-1-p processing domain-containing protein  38.46 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4619  Appr-1-p processing domain-containing protein  37.89 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672354  hitchhiker  0.00245683 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2167  Appr-1-p processing domain protein  32.09 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.028757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34.62 
 
 		 599 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1718  Appr-1-p processing domain protein  27.46 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0695  Appr-1-p processing domain protein  27.78 
 
 		 177 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.701989  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0075  appr-1-p processing domain-containing protein  28.06 
 
 		 182 aa  42.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2235  Appr-1-p processing domain protein  37.08 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00772619  hitchhiker  0.00000296103 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  26.9 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.466073  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4137  Appr-1-p processing domain-containing protein  22.22 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000896  hypothetical protein  36.36 
 
 		 170 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1293  hypothetical protein  28 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0201116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  34.62 
 
 		 599 aa  42.4  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2367  Appr-1-p processing enzyme family protein  37.97 
 
 		 177 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3249  Appr-1-p processing domain protein  35 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>