More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0259 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
460 aa  875    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  45.03 
 
 
505 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  46.64 
 
 
482 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.87 
 
 
467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.56 
 
 
468 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
581 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
574 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
539 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  39.7 
 
 
597 aa  193  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  38.57 
 
 
557 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  38.89 
 
 
586 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
601 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
607 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  43.81 
 
 
608 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  35.06 
 
 
594 aa  187  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  41.55 
 
 
544 aa  186  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
575 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
555 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
555 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
552 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  43.9 
 
 
594 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
577 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  41.61 
 
 
567 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  42.18 
 
 
554 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
547 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
551 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  43.26 
 
 
801 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  36.45 
 
 
558 aa  180  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
554 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  43.86 
 
 
557 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.54 
 
 
579 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
565 aa  176  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  40.16 
 
 
557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  38.93 
 
 
587 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
605 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  37.78 
 
 
450 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  41.2 
 
 
579 aa  169  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 
589 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  38.99 
 
 
648 aa  163  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
538 aa  160  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  36.39 
 
 
463 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
389 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
359 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
723 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  34.01 
 
 
503 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
450 aa  156  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  37.34 
 
 
457 aa  156  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
425 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  35.92 
 
 
356 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
389 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
473 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  40.42 
 
 
369 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35.76 
 
 
473 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
483 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
408 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.11 
 
 
512 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.64 
 
 
496 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  35.79 
 
 
470 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
471 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
471 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  37.57 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.87 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  39.14 
 
 
477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
359 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  29.04 
 
 
463 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
462 aa  146  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  29.04 
 
 
463 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.61 
 
 
463 aa  146  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
370 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
473 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.99 
 
 
461 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.04 
 
 
463 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  40.81 
 
 
593 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  36.59 
 
 
343 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  27.88 
 
 
463 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  37.32 
 
 
558 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
493 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
487 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.84 
 
 
456 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  28.71 
 
 
463 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.19 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.34 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
513 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
614 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  35.81 
 
 
354 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2730  histidine kinase  29.39 
 
 
385 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.484576 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
437 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.38 
 
 
463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
496 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.93 
 
 
461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  33.33 
 
 
518 aa  140  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
597 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>