160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0225 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  58.78 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  40.07 
 
 		 279 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  36.76 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  37.77 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 279 aa  99  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  24.45 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  34.8 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  25.56 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  25.56 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 		 264 aa  88.6  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 293 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  25.19 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24.45 
 
 		 272 aa  85.5  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  24.07 
 
 		 276 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  28.83 
 
 		 286 aa  85.1  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  26.37 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  22.96 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  22.96 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  23.62 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  23.68 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  32.65 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.05 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  28.95 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  29.89 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  31.41 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  37.76 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  30.22 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  29 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 282 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  24.13 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  25.18 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  47.56 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  21.69 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  31.7 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  24.54 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  23.83 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  43 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  30.22 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  23.51 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  49.28 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  40.38 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  27.31 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  30.12 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  26.2 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  37.08 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  64.44 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  52.31 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  54.39 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  46.84 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  32.27 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  27.59 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  32.35 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  32.35 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  34.55 
 
 		 178 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>