More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0154 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
245 aa  484  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  51.9 
 
 
238 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  51.48 
 
 
238 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
246 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  51.05 
 
 
244 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  48.35 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 
242 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  57.45 
 
 
105 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  31.42 
 
 
241 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 
246 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  28.34 
 
 
253 aa  82  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  29.1 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.21 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
256 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  37.76 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  38.46 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  38.46 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  36.62 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  36.62 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  36.62 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  36.36 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  29.28 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  34.51 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  28.07 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  27.63 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  31.72 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  27.63 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  25.4 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  51.43 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  29.69 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  29.69 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  29.69 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  29.69 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  28.91 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  29.69 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  25.45 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0342  transcriptional regulator, GntR family  27.91 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  27.63 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.33 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  48.48 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  28.38 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.68 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  26.36 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  25.33 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  43.24 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  27.39 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  28.57 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>