More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0142 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  75.66 
 
 		 436 aa  636    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  79.71 
 
 		 421 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  76.67 
 
 		 418 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  100 
 
 		 420 aa  855    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  76.37 
 
 		 422 aa  631  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  68.81 
 
 		 421 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  69.62 
 
 		 416 aa  592  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 426 aa  571  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  66.9 
 
 		 426 aa  564  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  66.35 
 
 		 425 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  67.3 
 
 		 424 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  68.5 
 
 		 422 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  67.3 
 
 		 419 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  66.19 
 
 		 420 aa  548  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 426 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  64.68 
 
 		 420 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 426 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 445 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 422 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 427 aa  532  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  66.03 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  63.88 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  65.33 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  65.79 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  65.79 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  64.44 
 
 		 419 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  64.45 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  65.55 
 
 		 419 aa  521  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  61.43 
 
 		 433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  61.56 
 
 		 424 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  64.1 
 
 		 423 aa  508  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  58.12 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  57.41 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 422 aa  356  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  352  7e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 424 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 411 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 422 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 424 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 422 aa  332  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 427 aa  331  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 426 aa  326  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 425 aa  325  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 421 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 421 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 422 aa  323  5e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 423 aa  322  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 427 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 427 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 428 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 428 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>