29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0137 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  932    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  67.49 
 
 		 551 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  37 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0171  hypothetical protein  37.47 
 
 		 473 aa  133  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  28.15 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  32.62 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  29.67 
 
 		 575 aa  58.2  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  27.19 
 
 		 522 aa  57  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 694 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  26.46 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  33.71 
 
 		 539 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  29.88 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  32.14 
 
 		 551 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  34.04 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  28.4 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  27.16 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  33.82 
 
 		 522 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  30.99 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  31.16 
 
 		 486 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  30.43 
 
 		 594 aa  47  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  29.93 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  29.93 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  28.99 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  29.2 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  29.93 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  30.7 
 
 		 551 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  31.03 
 
 		 579 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  31.03 
 
 		 579 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  31.03 
 
 		 579 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>