More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0113 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
485 aa  986    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  59.34 
 
 
485 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  45.04 
 
 
482 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.05 
 
 
487 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  45.88 
 
 
485 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.03 
 
 
483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  45.75 
 
 
489 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  45.86 
 
 
489 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.17 
 
 
493 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  45.23 
 
 
491 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.25 
 
 
491 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  45.23 
 
 
491 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  45.23 
 
 
491 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.77 
 
 
483 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.53 
 
 
489 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  44.83 
 
 
491 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  43.83 
 
 
480 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.88 
 
 
485 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.6 
 
 
480 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  45.84 
 
 
491 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  43.99 
 
 
482 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.51 
 
 
488 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.09 
 
 
493 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.63 
 
 
484 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  41.09 
 
 
490 aa  341  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.49 
 
 
481 aa  340  4e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  40 
 
 
504 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  43.55 
 
 
490 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  42.35 
 
 
501 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  41.2 
 
 
495 aa  326  6e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  41.67 
 
 
503 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  39.08 
 
 
488 aa  316  5e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.57 
 
 
481 aa  310  5e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.26 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.32 
 
 
490 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.63 
 
 
486 aa  298  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  38.87 
 
 
488 aa  297  3e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.37 
 
 
504 aa  283  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  39.17 
 
 
489 aa  279  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 
473 aa  259  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  34.46 
 
 
492 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  36.33 
 
 
493 aa  250  4e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 
458 aa  249  9e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 
478 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.01 
 
 
924 aa  243  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  35.12 
 
 
471 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  33.54 
 
 
933 aa  229  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 
461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 
470 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.79 
 
 
476 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  33.65 
 
 
579 aa  223  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  34.02 
 
 
972 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 
503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  33 
 
 
487 aa  217  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  32.68 
 
 
487 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  32.45 
 
 
921 aa  209  6e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  35.76 
 
 
578 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 
472 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 
573 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 
547 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 
577 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.22 
 
 
574 aa  196  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  35.99 
 
 
640 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 
570 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 
610 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  35.51 
 
 
639 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 
642 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 
584 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 
643 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  32.97 
 
 
611 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 
954 aa  177  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 
645 aa  177  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  33.85 
 
 
701 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 
630 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  30.82 
 
 
586 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.21 
 
 
681 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  36.22 
 
 
629 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  35.43 
 
 
629 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  35.43 
 
 
629 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  35.17 
 
 
629 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  31.9 
 
 
647 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 
634 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  33.88 
 
 
641 aa  171  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 
631 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  31.77 
 
 
646 aa  170  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  33.25 
 
 
646 aa  169  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  35.68 
 
 
646 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 
634 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 
535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  28.78 
 
 
586 aa  165  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.34 
 
 
647 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.13 
 
 
645 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  34.03 
 
 
646 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  31.49 
 
 
682 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  29.1 
 
 
661 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  32.33 
 
 
631 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
631 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 
547 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  32.99 
 
 
709 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 
767 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>