63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0098 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  57.46 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  40.93 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  36.95 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  37.43 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 187 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  36.7 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 190 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 190 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 190 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  30.53 
 
 		 232 aa  92  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  34.08 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 232 aa  88.2  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  32.42 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  29.28 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  20.77 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  20.77 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  21.51 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  26.54 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  21.54 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  20.97 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  20.97 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  20.97 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  20.97 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  32.47 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  20.77 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  20.43 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  35.09 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  31.87 
 
 		 112 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  27.56 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  40.51 
 
 		 108 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  25.27 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  31.41 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 181 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  30.09 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>