More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0091 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  100 
 
 		 204 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  72.63 
 
 		 190 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  62.38 
 
 		 202 aa  237  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.71 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  61.39 
 
 		 201 aa  228  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.91 
 
 		 201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.96 
 
 		 201 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.46 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  54.46 
 
 		 227 aa  204  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  55.94 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.45 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.94 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  52.48 
 
 		 201 aa  198  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  53.96 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.96 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.48 
 
 		 201 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.45 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  52.97 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.99 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  53.96 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.47 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.74 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  49.5 
 
 		 197 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.75 
 
 		 204 aa  181  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.51 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  43.07 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  42.57 
 
 		 200 aa  174  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  42.57 
 
 		 200 aa  174  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 200 aa  174  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.51 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  42.57 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  42.57 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  42.57 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  41.58 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.52 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.08 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.5 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.53 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.48 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.53 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  42.36 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.55 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  42.38 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.21 
 
 		 200 aa  147  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  48.51 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  39.3 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  44.06 
 
 		 198 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.67 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  35.68 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.06 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  44.08 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  34.16 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.23 
 
 		 212 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 219 aa  130  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  39.81 
 
 		 218 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 219 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.13 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>